汇总：生物信息学常用数据库、软件及下载文档

NCBI []

NCBI (National Center for Biotechnology Information）是特指美国国立生可作电子技术接收者中都心

EMBL []

欧洲分子会生可作学检验室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）

DDBJ []

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年建立，是21世纪三大DNA 资料库之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI资料库共同组成国际DNA资料库

CNGB []

中都国各地区资料库（China National GeneBank）位于东莞大鹏新近区，是紧接著21世纪三大资料库之后的当今世界第四大各地区级资料库。它是中都国首个，也是唯一一个各地区基因组库，相对于当今世界另外三个基因组库而言，各地区基因组库仪器保存的规模、存储量和可访问的资料量唯是当今世界最大。

BIGD []

中都国各地区基因组医学资料中都心 生命与健康大资料中都心 (National Genomics Data Center BIG Data Center)

miRBase []

piRNAbank []

piRNAbank []

SILVA []

LncRNAdb []

真核生可作

LncRNAwiki [_Page]

人类长非编码RNA资料库

Rfam[]

近似于Pfam的RNA堂兄弟译文资料库

Human protein atlas [ ]

人体细胞会在细胞会、组织、病理条件下的暗示

Pfam []

Pfam是细胞会质堂兄弟的资料库，仅限于使用隐马尔可夫模型生成的译文和多氨基酸基因组序列。

SwissProt []

手动译文的非冗余细胞会氨基酸资料库

UniProt [ ]

PIR []

Antibodies []

BRENDA [ ]

HPRD []

InterPro []

通过整合多个细胞会涉及资料库，提供了一个方便的对细胞会氨基酸顺利完成功能译文的平台，仅限于对细胞会质堂兄弟、核糖体、功能位点的得出结论

iProClass []

PRF []

REBASE []

PDB []

通过检验测的骨架

SCOP []

CATH []

PSI []

PROSITE []

最全面

Pfam []

最专业

ProDom []

CCD []

Prints []

SMART [ ]

TIGRFAM []

STRING []

DIP []

检验验证的细胞会电磁场资料库

BioGRID [] ：

IntAct [ ]

MapMan：一个功能强大的葡萄糖间接地核对和编辑的软件

KEGG []

GO []

NCBI BioSystems []

IMP []

plantCyc []

MANET [ ]

MetaNetX [ ]

MataboLights []

HMDB []

YMDB []

ECMDB []

Planteome []

dbGaP []

IPPN []

GeneCard []

Gene Wiki[_Wiki ]

Blast []

Interproscan []，

WEGO []

KAAS []

FGENESH []

AUGUSTUS [ ]

GENESCAN []

GeneMark []

Glimmer []

Exon-Intron Graphic Maker []

根据候选基因组的位点和内含子等接收者绘制基因组骨架

Blastp [_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome]

可在线获取细胞会核糖体的译文和左边接收者

ArrayExpress [ ]

资料来自EMBL的生可作医学功能基因组学检验的资料；

BAR []

在资料分析基因组功能时，通常会参照基因组的暗示方式上，即基因组在植可作并不相同组织并不相同发育初的暗示重元素变化。通过在线资料分析网站BAR对候基因组顺利完成暗示资料分析。 是一个植可作生信资料分析人力网站，用该网站资料分析基因组暗示时，不仅可以给予基因组暗示方式上的热图，还可以给予可视化的电子发光图片，准确呈现基因组在植可作组织中都的暗示左边。

GSDS []

Gene Structure Display Server，基于基因组译文文件绘制氨基酸基因组骨架等功能

ProtParam []

细胞会特点资料分析是特指细胞会的一些可作理和生物化学给可知，如分子会量、等电点、氨基酸和原子组成、消光比值、半衰期、不稳可知比值、脂肪人和氨基酸特指数、亲近岸。这些给可知，有助于顺利完成细胞会的涉及生化检验。比如在体外体系（大肠杆菌、酵母等）暗示和纯化目的细胞会时，必需考虑细胞会的分子会量、等电点、消光比值、不稳可知比值和亲近岸等。在蛋白酶活检验中都，也必需根据这些给可知可用性检验体系。

Protscale []

细胞会氨基酸的亲疏近岸主要由其侧链羧基R，如果R只是H或是C、H两元素组成的话，都是疏水的，如果富含重氮侧链羧基，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是重氮的（疏水的）。疏近岸氨基酸有过氧化物、谷氨酸、苯丙氨酸、缬氨酸、赖氨酸、异赖氨酸、丙氨酸和糖类（甲硫氨酸）。疏近岸氨基酸在细胞会质内部，在保持细胞会质的三级骨架上，蛋白酶和基质、抗体和抗原间的电磁场等各种非共价键的分子会融合方面，具有关键性关键作用。

TMHMM []

细胞会的跨越骨架资料分析对于得出结论细胞会的亚细胞会相对于密切涉及。如果具有跨越骨架，细胞会很也许相对于于细胞会中都与细胞会膜涉及的骨架，如细胞会质细胞会膜、叶绿体细胞会膜或线粒体细胞会膜等内细胞会膜管理系统。此外，细胞会跨越骨架资料分析对于细胞会功能资料分析也有一可知的设法。比如某细胞会没有跨越骨架，但是亚细胞会相对于检验显示其可相对于于细胞会膜涉及骨架，这说明该细胞会也许通过其他细胞会膜相对于细胞会招揽过去的。

SignalP []

峰接收器左边为接收器肽切开点，峰之后的氨基酸为接收器肽

接收器肽是特指为了让新近多肽的细胞会质向分泌物通路转回的较短肽链，常位于细胞会的N-末端，负责把细胞会质为了让到并不相同骨架的亚细胞会器内。编码分泌物细胞会的mRNA在翻译时首先多肽N末端的接收器肽，它被接收器肽识别细胞会(SRP)所识别，SRP将核糖体空投至细胞会内上，细胞会内细胞会膜上的 SPR 受体识别并与之融合。新近多肽细胞会在接收器肽为了让下出发细胞会内内腔，而接收器肽则在接收器肽蛋白酶的关键作用下被手术。由于它的为了让，新近生的多肽就需要通过细胞会内细胞会膜重回腔内，终究被分泌物到胞外。在宿主菌中都暗示外源细胞会时，可用接收器肽为了让外源细胞会相对于分泌物到胞外，提升细胞会可溶性，在原核暗示管理系统（大肠杆菌、芽孢杆菌等）和真核暗示管理系统（如毕秃酵母）中都均有应用。

NetPhos []

KinasePhos-2.0 []

细胞会质一氧化氮特指由细胞会质激蛋白酶裂解的把 ATP 的葡萄糖基转回到底可作细胞会质氨基酸残基（过氧化物、苏氨酸、过氧化物）上的过程，或者在接收器关键作用下融合 GTP（通常以 GTP 取代 GDP），是生可作体内一种一般来说的调节方式，在细胞会接收器转导的过程中都起关键性关键作用。在接收器远超时通过给予一个或几个葡萄糖控股公司而被过氧化物，而在接收器西移动时能去除这些控股公司，从而失去活性。有时某个接收器细胞会一氧化氮通常引发下游的细胞会依次引发一氧化氮，形成一氧化氮反馈反应。

二、生可作接收者学的软件及下载链接：

Clustal:

MEGA:

MAFFT:

Sequence Matrix:

PGDSpider:

DnaSP v6:

Arlequin:

MapMan：

PartitionFinder:

jModelTest:

IQ-TREE:

IQ-TREE在线:

RaxmlGUI:

Mrbayes 3.2.7:

PhyloSuite:

BEAST:

Figtree:

Tracer:

PopART:

Network:

Structure:

CLUMMP:

Distruct:

Migrate-N:

Phylonet: 或