Nat Biotechnol：深入研究不能重复？可能是HeLa细胞系“变”了

HeLa蛋白质早已在世界各地的许多研究小组培育了近70年，并且长期以来被普遍认为是无限供应的恒定的相近蛋白质。然而，2翌年18日刊载在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新早已有，蛋白质在相异研究小组二者之间存在太大相异，这招致了对蛋白质另有分析技术性的非议。“我很高兴看到这项分析，但在都是上我并不感到惊讶，”休斯凯特琳癌症中所心的分子可药理学家Prasad Jallepalli说，他很难加入这项分析。这并不是HeLa蛋白质另有自应运而生以来第一次出现多样化的另据：过往，其他分析小组也证明了HeLa蛋白质基因突变躯二者之间在基因和RNA表达的显着相异。这项最新分析首次全面分析了各种HeLa基因突变躯的遗传基因突变（相异批次的HeLa蛋白质另有与世隔绝在世界各地的各个研究小组），并且首次证明遗传值得注意导致了酶表达和表型的波动。HeLa蛋白质“变了”？在这项分析中所，分析工作人员从6个国家的13个研究小组收集了14份HeLa结果显示，并在相近的研究小组条件下进行培育。他们首先定量了基因拷贝数基因突变，揭示了它们DNA二者之间的显着相异。结果发现，HeLa基因突变躯二者之间，特别是CCL2和Kyoto基因突变躯二者之间存在着巨大的值得注意。实质性的早已有，许多这些遗传相异生成为mRNA生成成的波动，并且在较小程度上生成为酶丰度的波动。分析工作人员通报说，HeLa CCL2和Kyoto蛋白质另有的核苷酸组和酶组谱彼此二者之间的相异，就像来自两种相异多种类型有组织的癌蛋白质另有二者之间的相异一样。HeLa基因突变躯在培育反复中所生长速度也相异，一些蛋白质群必须17.5星期才能缩减到，而另一些蛋白质在相近的培育条件下必须话费超过32星期。它们对沙门氏菌受到感染的反应也有所相异：与其他两种变躯相比，一种变躯对受到感染的持续性较低，分析工作人员将其归因于持续性的酶复合物，这种酶复合物在病原躯进入宿主蛋白质中所起作用。在一项之外的物理中所，分析小组通过培育蛋白质另有三个翌年，来观察HeLa基因突变躯的表型是否亦会随着时间发生波动。分析工作人员记录了一时期蛋白质和晚期蛋白质二者之间表型相异大约6%。苏黎世联邦理工分子可另有统药理学分析所的Ruedi Aebersell教授是该分析的合着者，他说，“即使在同一个研究小组里，这些蛋白质的相异和波动速度也是非常极快的。”他估计，如果一个分析生在项目开始时用HeLa蛋白质另有做了一个物理，并在六个翌年后被要求重复这个物理，他们才亦会得到相异的结果。关于分析中所的“可复制性巨变”的讨论大多数集中所在测试方法、分析之外的缺陷，以及作为主要驱动因素的受污染或挂确表单的蛋白质另有。但是Aebersell普遍认为，HeLa蛋白质另有和癌蛋白质另有的药理学相异或许是关键。为什么亦会“变”？普林斯顿大学的蛋白质药理学家Tim Stearns普遍认为有几个或许的原因可以解释为什么蛋白质另有在长时间培育下亦会发生波动。首先，HeLa蛋白质是已知DNA不稳定性癌蛋白质，因此很或许随时间随机基因。此外，它们还亦会在研究小组中所受到各种生长条件的严重影响，这才亦会促成蛋白质演化出独特的特征。例如，他说，哺乳动物蛋白质的培育有数将其培育到充满一个培育皿为止，从培育皿中所抽取一部分蛋白质，然后将它们放到另一个培育皿中所生长，这一反复称做分裂。“每个人做这件事的形式都有点相异，”他说道。最新这些发现，对于全人类培育蛋白质的分析结果的解释和重现性有一定的意味。Aebersell和他的同事在论文中所提出了几个具躯的解决方案。首先，分析工作人员不该用到癌蛋白质另有的一时期传代，并确保在同一蛋白质另有的相异结果显示中所重复同一蛋白质另有的物理。更重要的是，药理学家不该清楚地通报他们在假定的分析中所用到的蛋白质另有基因突变躯。